საჰაერო ხომალდების ვარგისობისა და რეგისტრაციის დეპარტამენტის ფუნქციებია:
- საქართველოს სამოქალაქო საჰაერო ხომალდების სახელმწიფო რეესტრში რეგისტრაცია;
- საჰაერო ხომალდის ფრენისათვის ვარგისობის დადგენა და სათანადო საბორტო დოკუმენტაციის გაცემა;
- ავიასაწარმოების მიერ საავიაციო ტექნიკის ტექნიკურ ექსპლუატაციაზე ზედამხედველობა;
- საავიაციო ტექნიკის ტექნიკური მომსახურების საწარმოს სერტიფიცირება;
- უცხო ქვეყნის საჰაერო ხომალდების საინსპექციო შემოწმება.